Typedef Vtml200VTML200 scoring matrix.
VTML200 scoring matrix.
| Defined in | <seqan/score.h> |
|---|---|
| Signature |
typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecVtml200> > Vtml200;
|
Overview
A 4
B -1 4
C 1 -3 12
D -1 5 -4 6
E -1 2 -4 3 5
F -3 -5 -3 -6 -5 8
G 0 0 -2 -1 -1 -5 8
H -2 1 -2 0 0 0 -2 8
I -1 -4 0 -5 -4 0 -6 -3 5
J -2 -5 -2 -5 -4 1 -6 -3 4 4
K -1 0 -4 0 1 -5 -2 0 -3 -3 5
L -2 -5 -3 -5 -4 2 -5 -2 3 4 -3 5
M -1 -3 -1 -4 -3 1 -4 -3 2 3 -2 3 6
N -1 4 -2 3 1 -4 0 1 -4 -4 1 -4 -3 6
X -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
P 0 -1 -3 -1 -1 -4 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -3 -2 -2 9
Q -1 1 -3 1 2 -3 -2 2 -3 -3 2 -2 -1 1 -1 -1 5
R -2 -1 -3 -2 -1 -4 -2 1 -3 -3 4 -3 -2 0 -1 -1 2 7
S 1 1 1 0 0 -3 0 0 -3 -3 0 -3 -2 1 -1 0 0 -1 4
T 1 0 0 -1 -1 -3 -2 -1 -1 -2 0 -2 -1 0 -1 -1 0 -1 2 4
U -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1
V 0 -3 1 -4 -3 -1 -4 -3 4 3 -3 2 2 -3 -1 -3 -2 -3 -2 0 -1 4
W -4 -5 -6 -6 -6 3 -5 -1 -2 -2 -4 -1 -3 -5 -2 -4 -6 -3 -4 -5 -2 -4 15
Y -3 -3 0 -4 -3 5 -5 3 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -1 -5 -3 -2 -2 -3 -1 -2 4 9
Z -1 1 -4 2 4 -4 -2 1 -3 -3 2 -3 -2 1 -1 -1 4 0 0 -1 -1 -3 -6 -3 4
X -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1
* -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1
A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W Y Z X *